Fysisk eksamen
I mange tilfælde er den første test, som en læge vil gøre for at screene for seksuelt overførte sygdomme (STD'er) en grundig fysisk undersøgelse. Lægen vil gerne spørge om mands seksuelle historie og praksis, herunder om patienten har sex med mænd, kvinder eller begge, samt hvilken seksuel praksis man involverer, og om kondomer anvendes. Lægen kan også spørge, om patienten oplever symptomer i kønsorganet eller det mundtlige område. Endelig kan lægen bede om at undersøge mandens kønsorganer, mundhule og rektum. Målet med denne del af prøven er at vurdere, hvor stor patientens risiko for at indgå en STD er, og hvilke STD'er der sandsynligvis er. Det giver også lægen en mulighed for at uddanne patienten til seksuel praksis.
Genital swabs
Hvis lægen finder afvigelser på kønsorganerne, kan der kræves yderligere test. Nogle seksuelt overførte sygdomme får penis til at udskille en unormal udledning. Andre forårsager sår eller læsioner, der fremkommer på kønsorganerne eller i munden. I disse tilfælde vil lægen gerne have en prøve af vævet og væsken fra disse læsioner og sende dem til et laboratorium. Laboratoriet vil lede efter mikroorganismer, der kan forårsage STD'er i disse prøver (herunder både bakterier og vira). Lægen kan også holde en bomuldspinne op i urinrøret i et forsøg på at indsamle mikroorganismer der bor der.
Blod- og urintest
Andre seksuelt overførte sygdomme kan muligvis ikke påvises via genital undersøgelse. I disse tilfælde kan der kræves blod- og urintest. Disse tests er særligt gode til at detektere vira, som kan forårsage systemiske virkninger, såsom HIV eller hepatitis. En urinprøve kan også være nødvendig for at teste for syfilis. Disse tests må ikke udføres som led i en standard STD test, medmindre patienten beder om dem, da de typisk er dyrere.
