Brintcellerne kan revolutionere transportsektoren og muligvis også hjemme el. Det er brændstoffet - det flydende hydrogen - der gennemgår reaktionen inde i brændselscellen, der giver de fleste skeptikere pause. Den holdes under intense tryk på 3.000 til 10.000 lbs. pr. kvadrat tomme, det er brændbart og tanken om det minder om billeder af Hindenburg-katastrofen. Frygten er delvist bygget på myte, men der er sikkerhedsproblemer at overveje, inden man skifter til en brintøkonomi.
Eksplosiv fare
Hydrogen er eksplosiv i høje koncentrationer, men tendensen er at brænde frem for at eksplodere. Denne egenskab udelukker ikke helt den eksplosive fare, men det gør den så sikker som ethvert flygtigt materiale, som bruges som brændstof. Brændstoftanke har været underlagt strenge test og værst tænkelige scenarier. I en undersøgelse, der blev offentliggjort i november 1996 af "The New Scientist", testede fysiker Rob Edwards en fuld brinttank ved at slukke den i en 1600-graders flamme i 70 minutter uden hændelse. Han punkterede også en tank med rustningspiercingkugler. Brintet sommetider brændt og sommetider spredes, men det eksploderede ikke.
Brændbarhed
Hydrogen er ekstremt brandfarlig, da enhver kemisk studerende, der har antændt hydrogen i et reagensglas, kan attestere. Det tager 14 gange mindre energi at antænde hydrogen end det gør at antænde naturgas, ifølge et hvidbog af Amory Lovins for Rocky Mountain Institute. Det kræver en koncentration i luften fire gange højere end benzindamp til tænding, men gør hydrogen som brændstof en fare, der ligner ethvert brændbart brændsel, der anvendes i dag, ifølge Lovins. Hydrogen udgør en ekstra fare for de første respondenter i tilfælde af brand, fordi en brændeflamme er næsten usynlig i dagslys.
Toksicitet
Flydende brint bryder straks ved kontakt med luft ved standardtemperatur og tryk. En overflod af indsamlet brint i områder, der ikke er godt ventileret, udgør en kvælningsrisiko for folk i området. Væskegas er lugtfri og farveløs, og reaktionen med ilt, der omdanner det frie hydrogen til uskadelig vanddamp, sker meget langsomt ved omgivelsestemperatur. Som følge heraf skaber det frie hydrogen et iltmangel, som kan forårsage hovedpine, sanseforstyrrelser, bevidstløshed eller endog død.
Klima forandring
Hydrogen kan ekstraheres fra en række "råmaterialer", herunder naturgas, vand og jævn olie og kul. Størstedelen af brint til industriel anvendelse udvindes fra fossile brændstoffer i en proces, der frigiver rigelige mængder kuldioxid i atmosfæren, ifølge Naturrådets Forsvarsråd. Selv hydrogen udvundet af vand i det hele gør det med elektricitet produceret af fossile brændselskilder. Indtil hydrogenproduktion er kulstofnød, vil drivkraft med hydrogen ikke være en effektiv global opvarmningsstrategi.
