Ifølge Verdenssundhedsorganisationen er salmonellabakterier en af de mest almindelige årsager til fødevarebåren sygdom rundt om i verden. I USA resulterer 1,4 millioner infektioner i over 150.000 lægebesøg, 15.000 indlæggelser og 500 dødsfald hvert år. Selv om salmonellaforgiftning normalt forårsager mild, selvbegrænset gastroenteritis ("salmonellose"), kan det i visse tilfælde opstå langsigtede virkninger.
Metastatisk infektioner
I sjældne tilfælde undgår salmonella tarmene for at komme ind i blodbanen. Bloodstream infektion kan selv være dødelig og kan producere langsigtede komplikationer, når salmonella spredes (metastasererer) fra blodbanen og inficerer andre områder af kroppen. Eksempler på metastatisk salmonella infektioner er infektion i hjerteventiler og foring af hjertet (endokarditis), knoglen (osteomyelitis), nyrerne (pyelonefritis) og andre bløde væv inklusive hjernen. Typisk er disse infektioner langsomme og vokser meget længere end de 12 til 72 timer i forbindelse med klassisk salmonella gastroenteritis. De forekommer sjældent hos raske voksne og er meget mere almindelige hos mennesker med kompromitterede immunsystemer (såsom dem med aids, kræft, seglcelleanæmi) eller flere medicinske problemer.
Autoimmun sygdom
Efter salmonellaeksponering producerer immunsystemet antistoffer mod bakterierne. Desværre ligner salmonellabakterier en celleoverflademarkør, der er til stede hos mange mennesker. Resultatet er en autoimmun sygdom forårsaget af Reiter's syndrom, der forårsager kronisk ledsmerte (arthritis), øjenirritation (konjunktivitis med eller uden iritis) og problemer med vandladning (urethritis). I en undersøgelse fra 2001, der blev præsenteret i tidsskriftet Clinics in Infectious Disease, udviklede næsten en tredjedel af de mennesker, der var inficeret med Salmonella Dnteridis, en af de mest almindelige salmonella arter, arthritis, der fortsatte i op til 6 måneder, og næsten 50 procent rapporterede gentagelse efter at den oprindelige episode blev løst.
Kroniske bærere
I nogle tilfælde genvinder enkeltpersoner fra salmonellainfektion for at blive kroniske bærere. Det mest kendte eksempel på en human kronisk bærer af salmonella er "Typhoid Mary." J. W. Leavitt's 1996-bog "Typhoid Mary: Captive for Public Health" fortæller den sande historie om den asymptomatiske irsk-amerikanske kok, der er forbundet med 54 tilfælde og fire dødsfald i ni forskellige tyfusfeberepidemier i begyndelsen af 1900-tallet New York City.
I dag kan kroniske bærestater sædvanligvis udryddes med et forlænget antibiotikabehold, selv om individer kan være underlagt begrænsninger af den type arbejde, de kan udføre i mellemtiden. De fleste kroniske bærere er asymptomatiske. Imidlertid kan patienter med aids og andre former for immunforstyrrelser lide gentagne tilbageskridt, før antibiotika er effektive.